Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms