Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms