Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CFAP47Q6ZTR5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms