Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC73Q6ZRK6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms