Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms