Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP1Q6PKG0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP1Q6PKG0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms