Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP4Q6PIL6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNIP4Q6PIL6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms