Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNNM4Q6P4Q7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms