Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC41PQ6P2S7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC41PQ6P2S7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms