Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWSAP1Q6NVH7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms