Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CARMIL1Q5VZK9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL1Q5VZK9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms