Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms