Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms