Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKDCCQ504Y2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKDCCQ504Y2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms