Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms