Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NBPF1Q3BBV0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF1Q3BBV0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms