Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETM2Q2VYF4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM2Q2VYF4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms