Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SWI5Q1ZZU3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SWI5Q1ZZU3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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