Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q1T7F1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms