Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MSMPQ1L6U9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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