Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC142Q17RM4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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