Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN1Q16512 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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