Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERC1Q15751 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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