Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAM1Q15629 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TRAM1Q15629 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRAM1Q15629 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRAM1Q15629 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRAM1Q15629 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAM1Q15629 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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