Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB3GAP1Q15042 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3GAP1Q15042 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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