Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2H2Q13888 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF2H2Q13888 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms