Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF4BQ13523 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms