Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME3Q13232 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME3Q13232 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NME3Q13232 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NME3Q13232 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME3Q13232 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms