Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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