Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 STB4YMR019W 2850 nt1.34□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RPH1YER169W 2391 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YDR537CYDR537C 606 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 SMD1YGR074W 441 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 SEC28YIL076W 891 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YJR023CYJR023C 402 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 PLC1YPL268W 2610 nt1.33□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 ERG29YMR134W 714 nt1.32□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 PAI3YMR174C 207 nt1.32□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RIO2YNL207W 1278 nt1.32□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 IPP1YBR011C 864 nt1.32□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RAD9YDR217C 3930 nt1.32□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RSM18YER050C 417 nt1.31□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YGR115CYGR115C 780 nt1.31□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.31□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RPL33BYOR234C 324 nt1.31□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 HIR3YJR140C 4947 nt1.31□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 NDD1YOR372C 1665 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YLR422WYLR422W 5799 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 snR5snR5 204 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YGL042CYGL042C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RPI1YIL119C 1224 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 RPL40AYIL148W 387 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YLR302CYLR302C 363 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 TAP42YMR028W 1101 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YMR254CYMR254C 309 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 CMC2YBL059C-A 330 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YPL034WYPL034W 498 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 POP7YBR167C 423 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 SEC63YOR254C 1992 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 SKI3YPR189W 4299 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 IRR1YIL026C 3453 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 GRR1YJR090C 3456 nt1.3□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 snR59snR59 78 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YDR042CYDR042C 603 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 VPS74YDR372C 1038 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 TDA2YER071C 381 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 FAR7YFR008W 666 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 HSK3YKL138C-A 210 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YLR458WYLR458W 381 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 ATP15YPL271W 189 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 MGR1YCL044C 1254 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 Q0255Q0255 1419 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 BST1YFL025C 3090 nt1.29□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 snR83snR83 306 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 COX3Q0275 810 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 ATP18YML081C-A 180 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 CYB5YNL111C 363 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YNL179CYNL179C 438 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 YPR170CYPR170C 336 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 MDM20YOL076W 2391 nt1.28□□□□□ -2.2
RIO1Q12196 CRM1YGR218W 3255 nt1.28□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 GPM2YDL021W 936 nt1.27□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 TSA2YDR453C 591 nt1.27□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YHL037CYHL037C 402 nt1.27□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 BUD19YJL188C 309 nt1.27□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SPO75YLL005C 2607 nt1.27□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 KAR9YPL269W 1935 nt1.27□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SMC4YLR086W 4257 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YJL086CYJL086C 369 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 ACF4YJR083C 930 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 RPC25YKL144C 639 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YPT6YLR262C 648 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YSY6YBR162W-A 198 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YCL002CYCL002C 792 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 TRM732YMR259C 4263 nt1.26□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 DOT6YER088C 2013 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SNO3YFL060C 669 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 MND1YGL183C 660 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 IST3YIR005W 447 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SDS22YKL193C 1017 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 VPS63YLR261C 327 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 GRX8YLR364W 330 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 GIM5YML094W 492 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SNO2YNL334C 669 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 ATP20YPR020W 348 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 CTF4YPR135W 2784 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 ASM4YDL088C 1587 nt1.25□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YFL012WYFL012W 447 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 RAD6YGL058W 519 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YGL109WYGL109W 324 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 YLR031WYLR031W 561 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 GAL7YBR018C 1101 nt1.24□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SHE4YOR035C 2370 nt1.23□□□□□ -2.21
RIO1Q12196 SEY1YOR165W 2331 nt1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms