Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 SIP3YNL257C 3690 nt4.21□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 BAS1YKR099W 2436 nt4.21□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 EMP24YGL200C 612 nt4.2□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YLR416CYLR416C 399 nt4.2□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YBR099CYBR099C 384 nt4.2□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 NUP120YKL057C 3114 nt4.2□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YDL176WYDL176W 2127 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YEL043WYEL043W 2871 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 PRE4YFR050C 801 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YGL024WYGL024W 336 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YGL069CYGL069C 465 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 POG1YIL122W 1056 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YPR014CYPR014C 330 nt4.19□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 RPS17BYDR447C 411 nt4.18□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YDR341CYDR341C 1824 nt4.18□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 HSC82YMR186W 2118 nt4.18□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 SNU114YKL173W 3027 nt4.17□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 PLC1YPL268W 2610 nt4.17□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 HEH2YDR458C 1992 nt4.17□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 YIR044CYIR044C 186 nt4.17□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 APL4YPR029C 2499 nt4.17□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 HMG1YML075C 3165 nt4.16□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 GUP1YGL084C 1683 nt4.16□□□□□ -1.74
YRR1Q12172 CFT2YLR115W 2580 nt4.15□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 ALK2YBL009W 2031 nt4.15□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 CPA2YJR109C 3357 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YDR193WYDR193W 399 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 ISA1YLL027W 753 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YOR102WYOR102W 351 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 RPS23BYPR132W 438 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 PWP2YCR057C 2772 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 GIN4YDR507C 3429 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 SKG6YHR149C 2205 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 NOP53YPL146C 1368 nt4.14□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 REG1YDR028C 3045 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 CIN1YOR349W 3045 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 LSO2YGR169C-A 279 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YOR333CYOR333C 417 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 CHS3YBR023C 3498 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 KAR3YPR141C 2190 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 RSC1YGR056W 2787 nt4.13□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 TFC8YPL007C 1767 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YNR065CYNR065C 3351 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 ACM1YPL267W 630 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 DOT6YER088C 2013 nt4.12□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt4.11□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YOR218CYOR218C 420 nt4.11□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YPK9YOR291W 4419 nt4.11□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 ZDS1YMR273C 2748 nt4.1□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YLR282CYLR282C 342 nt4.1□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YAK1YJL141C 2424 nt4.1□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 IOC2YLR095C 2439 nt4.1□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 COY1YKL179C 2040 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 SEN1YLR430W 6696 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YER053C-AYER053C-A 114 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 RSM19YNR037C 276 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 GPI13YLL031C 3054 nt4.09□□□□□ -1.75
YRR1Q12172 APC11YDL008W 498 nt4.08□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt4.08□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 YOR345CYOR345C 351 nt4.08□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 MCM10YIL150C 1716 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 DUF1YOL087C 3351 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 RNR1YER070W 2667 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 EMC1YCL045C 2283 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 DBP7YKR024C 2229 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 PAN3YKL025C 2040 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 MSH2YOL090W 2895 nt4.07□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 COG3YER157W 2406 nt4.06□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 RAM2YKL019W 951 nt4.06□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 OSH2YDL019C 3852 nt4.06□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 NCR1YPL006W 3513 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 GSC2YGR032W 5688 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 CLN3YAL040C 1743 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 YBL065WYBL065W 345 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 MTR10YOR160W 2919 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 MCD4YKL165C 2760 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 PHO81YGR233C 3537 nt4.05□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 YCG1YDR325W 3108 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 YBR225WYBR225W 2703 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 EFR3YMR212C 2349 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 SIR3YLR442C 2937 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 MIS1YBR084W 2928 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 RPL22AYLR061W 366 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 TIM12YBR091C 330 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 TMA108YIL137C 2841 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 ABP140YOR239W 1887 nt4.04□□□□□ -1.76
YRR1Q12172 FLO10YKR102W 3510 nt4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms