Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms