Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms