Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN12Q05209 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN12Q05209 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms