Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F1Q01094 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms