Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX1P83916 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX1P83916 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX1P83916 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX1P83916 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX1P83916 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX1P83916 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms