Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPNP63162 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms