Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL23P62829 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms