Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF3P57682 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF3P57682 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLF3P57682 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms