Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HADHBP55084 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HADHBP55084 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HADHBP55084 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HADHBP55084 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HADHBP55084 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms