Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PLTPP55058 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLTPP55058 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLTPP55058 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms