Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms