Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX2P50458 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX2P50458 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LHX2P50458 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX2P50458 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX2P50458 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX2P50458 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX2P50458 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX2P50458 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX2P50458 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms