Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF6P49848 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF6P49848 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF6P49848 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF6P49848 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF6P49848 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF6P49848 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF6P49848 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms