Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI2P48788 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms