Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME1P48163 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME1P48163 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME1P48163 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ME1P48163 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME1P48163 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME1P48163 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME1P48163 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms