Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB2P47870 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms