Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4P46934 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms