Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTHFRP42898 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms