Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC5P40937 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC5P40937 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC5P40937 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC5P40937 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFC5P40937 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFC5P40937 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms